Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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