Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED12Q93074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED12Q93074 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED12Q93074 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED12Q93074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED12Q93074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED12Q93074 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED12Q93074 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED12Q93074 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED12Q93074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED12Q93074 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED12Q93074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED12Q93074 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED12Q93074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED12Q93074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED12Q93074 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED12Q93074 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED12Q93074 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED12Q93074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED12Q93074 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED12Q93074 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED12Q93074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED12Q93074 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED12Q93074 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED12Q93074 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED12Q93074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED12Q93074 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED12Q93074 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED12Q93074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED12Q93074 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED12Q93074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED12Q93074 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED12Q93074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED12Q93074 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED12Q93074 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED12Q93074 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms