Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRG4Q92954 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRG4Q92954 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PRG4Q92954 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRG4Q92954 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms