Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC4Q92889 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC4Q92889 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1474.1 ms