Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNQ92622 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNQ92622 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms