Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BAP1Q92560 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BAP1Q92560 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms