Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGP1Q92546 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGP1Q92546 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms