Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX19Q92543 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX19Q92543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX19Q92543 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms