Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASKIN2Q8WXE0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASKIN2Q8WXE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms