Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCN9Q8WX39 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCN9Q8WX39 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms