Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCFD1Q8WVM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCFD1Q8WVM8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms