Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP27Q8WVK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP27Q8WVK2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms