Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSMCE1Q8WV22 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE1Q8WV22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms