Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBAR1Q8TDU6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPBAR1Q8TDU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBAR1Q8TDU6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms