Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP1Q8TDR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP1Q8TDR0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.2 ms