Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms