Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYRIPQ8NFW9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYRIPQ8NFW9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 824.4 ms