Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST4Q8NFU0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms