Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC197Q8NCU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC197Q8NCU1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms