Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM35BQ8NCS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms