Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL23Q8NBE8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL23Q8NBE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL23Q8NBE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms