Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP38Q8NB14 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms