Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KBTBD3Q8NAB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD3Q8NAB2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD3Q8NAB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD3Q8NAB2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms