Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG16L2Q8NAA4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L2Q8NAA4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms