Protein–RNA interactions for Protein: Q8N539

FIBCD1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIBCD1Q8N539 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FIBCD1Q8N539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FIBCD1Q8N539 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FIBCD1Q8N539 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms