Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHTF2Q8N3S3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF2Q8N3S3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms