Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
VPS8Q8N3P4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
VPS8Q8N3P4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
VPS8Q8N3P4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms