Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf33Q8N1A6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf33Q8N1A6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf33Q8N1A6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf33Q8N1A6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf33Q8N1A6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf33Q8N1A6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf33Q8N1A6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms