Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC2Q8N158 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GPC2Q8N158 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC2Q8N158 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC2Q8N158 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms