Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJD3Q8N144 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD3Q8N144 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJD3Q8N144 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms