Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIRREL3Q8IZU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIRREL3Q8IZU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIRREL3Q8IZU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms