Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D3Q8IZS8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D3Q8IZS8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D3Q8IZS8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms