Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC170Q8IYT3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC170Q8IYT3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms