Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NIM1KQ8IY84 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NIM1KQ8IY84 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NIM1KQ8IY84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NIM1KQ8IY84 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms