Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOT2Q8IXI1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms