Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHERPQ8IWX8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms