Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LDLRAD3Q86YD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD3Q86YD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms