Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM25Q86YD3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM25Q86YD3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM25Q86YD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM25Q86YD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms