Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM135Q86UB9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM135Q86UB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms