Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF39Q86UA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms