Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APTXQ7Z2E3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APTXQ7Z2E3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms