Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP2Q7RTS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP2Q7RTS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms