Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP9Q7RTR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms