Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HS2ST1Q7LGA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HS2ST1Q7LGA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms