Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SV2BQ7L1I2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2BQ7L1I2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms