Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPGS1Q6ZTW0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms