Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM43BQ6ZT52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM43BQ6ZT52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM43BQ6ZT52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms