Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY4Q6ZNE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY4Q6ZNE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY4Q6ZNE9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms