Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPTNQ6XPR3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms