Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO4Q6UY18 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms